对全区46个国控断面（点位）进行了监测，其中41个地表水河流（国界河流）断面，5个湖库点位；全区地级以上城市22个集中式饮用水水源地进行了监测，共获得4680个数据。

18个河流评价、排名、考核断面各项监测指标均符合《地表水环境质量标准》（GB3838-2002）表1中Ⅲ类标准；4个湖库评价、排名、考核点位中除扎西岛（纳木错）氟化物(本底值较高)超《地表水环境质量标准》（GB 3838-2002）表1中Ⅴ类标准，其余各项监测指标均符合《地表水环境质量标准》（GB3838-2002）表1中Ⅲ类标准。